Bahagian Pengurusan Teknologi Maklumat (BPTM) dikuatkuasa pada 1 September 2005 dengan waran perjawatan sebanyak 16 perjawatan dan bertanggung jawab terus kepada Timbalan Ketua Setiausaha (Operasi).
Pada tahun 2018, BPTM telah mewujudkan lima (5) seksyen iaitu,
i.Seksyen Operasi, Rangkaian dan Keselamatan
ii.Seksyen Dasar
iii.Seksyen Aplikasi Korporat
iv.Seksyen Aplikasi Pengguna
v.Unit Pentadbiran
BPTM bertanggungjawab dalam menyediakan perkhidmatan ICT merangkumi khidmat nasihat, pembangunan sistem, keselamatan ICT dan khidmat teknikal kepada bahagian – bahagian bagi memastikan perkhidmatan- perkhidmatan ICT berjalan dengan cekap dan lancar seiring dengan teras perkhidmatan Kementerian Sains, Teknologi dan Inovasi (MOSTI).
BPTM juga menjalankan pemantauan projek ICT melalui tadbir urus ICT seperti Jawatankuasa Pemandu ICT (JPICT), Jawatankuasa Teknikal ICT (JTI), Jawatankuasa Induk Pemantauan Projek Aplikasi Ibu Pejabat (JIPPAIP), Jawatankuasa Keselamatan ICT (JKICT) dan Jawatankuasa Teknikal Portal